高效液相色谱仪的应用范围日益扩展。由于它使用了非破坏性检测器，样品被分析后，在大多情况下，可除去流动相，实现对少量珍贵样品的回收，亦可用于样品的纯化制备。

一、分离效能高：

由于新型高效微粒固定相填料的使用，液相色谱填充柱的注销可达5×10 3～3×10 4块/m理论塔板数，远远高于气相色谱填充柱10 3块/m理论塔板数的柱效。

二、选择性高

由于液相色谱柱具有高柱效，并且流动相可以控制和改善分离过程的选择性。因此，高效液相色谱仪不仅可以分析不同类型的有机化合物及其同分异构体，还可以分析在性质上极为相似的旋光异构体，并已在高疗效的合成药物和升华药物的生产控制分析中发挥了重要作用。

三、检测灵敏度高

在高效液相色谱仪中使用的检测器大多数都具有较高的灵敏度。如被广泛使用的紫外吸收检测器，小检出量可达10 9 g，用于痕量分析的荧光检测器，小检出量可达10-12 g。

四、分析速度快

由于高压输液泵的使用，相对于经典液相色谱，其分析时间大大缩短，当输液压力增加时，流动相流速会加快，完成一个样品的分析时间仅需几分钟到几十分钟