虽然气相色谱柱的种类很多，但分离效果主要取决于固定相，柱长，柱内径和液膜厚度等因素。原则上，这几个因素的分离效应相同。只要这柱子的几个因素相同。
因此，研究伙伴从列中选择以下几个方面：
1、柱长的选择分辨率与柱长的平方根成正比。在其他条件相同的情况下，需要4倍的列长度来获得双倍分辨率。
较短的色谱柱适用于较简单的样品，特别是那些由结构，极性和挥发性差异很大的组分组成的样品。一般：15米短柱，用于快速分离更简单的样品，也适用于扫描分析;30m色谱柱是常用的色谱柱长度，大多数分析是在此长度的色谱柱上完成的;50米，60米或更长的长柱用于分离更复杂的样品。应注意，柱长的增加也增加了分析时间。

2、色谱柱内径的选择色谱柱直径直接影响色谱柱的效率，保留特性和样品容量。小口径柱比大口径柱具有更高的效率，但柱容量更小。0.25mm：高柱效和低柱容量。要将复杂样本分开。0.32mm：柱效率略低于0.25mm，但柱容量高出约60％。0.53mm：柱容量与填充柱相似。它可用于分流注射或不分流注射。当柱容量是主要考虑因素（例如痕量分析）时，更适合选择大直径毛细管柱。
3、液膜厚度的选择液膜的厚度影响柱的保持特性和柱容量。厚度增加并且保持力也增加。0.1~0.2m：液膜厚度薄的毛细管柱比厚液膜的毛细管柱快，所需柱温低，高温下柱损小，适合高分析沸点化合物。0.25~0.5m：普通液膜厚度。厚膜：有利于低沸点化合物的分析。
4、固定相的选择不同固定不同分析物的不同效果，根据相似的相容性原理，性能越接近，相对于其固定的流动阻力越大，其保留时间越长。
该原理用于将不同性质的混合物彼此分离。